神经内科是克拉玛依市及周边地区神经内科疾病唯一诊治专科，承担本地区神经内科疾病的诊断、治疗、预防以及教学、科研工作。科室现有医护人员25人，其中4人硕士学历（医生组），10人本科学历，副主任医师4人，脑血管介入专家1人，中级职称6名，初级职称15名，承担着大量的教学任务，人才梯队结构合理，专科发展实力强。         科室开放床位共计38张，包括脑卒中单元、重症监护病房及普通病房，有肌电图室，脑血管病，癫痫、颅内感染等病种是神经内科研究重点。

感染科有医护人员21名，其中，主任医师3 人，副主任医师1 人，主治医师2 人，住院医师4人。主管护理师3人，护理师3人，护士5人。实际开设床位50张。诊治范围为各种感染性内科疾病尤其对各类肝炎及其晚期并发症的诊治及各系统结核病的诊治。获市局级及院级科技成果十余项，在各类专业杂志及学术会议上发表和交流学术论文数十篇。

血液肿瘤科目前共有医护人员43人，其中主任医师4名，副主任医师5名，副主任护师1名，其中博士研究生学历1人；硕士研究生学历9人。科室目前实际开放床位56张。是自治区癌痛规范化治疗病房，肿瘤专业为自治区重点专科。目前拥有肿瘤内科、肿瘤放疗及血液内科三个亚专业组，同时拥有独立的血液病实验室1个，肿瘤相关检测实验室1个，拥有先进医疗设备，已成为北疆地区具有较高影响力的特色专科，也是克拉玛依地区实力最强的肿瘤治疗专科及唯一的血液病专科。

中心医院心血管内科是自治区重点专科，是我市唯一心血管专业、心脏病介入治疗的专科。是克拉玛依市及周边地区心血管危重、疑难患者的诊断和治疗基地。

目前心血管内科有医护人员47人，医生16人，护士31人，硕士学历11人，正高人员2人，副高4人，具有先进、完备的仪器设备，拥有雄厚的科研力量和较高的科研水平，近年来主持及参与国家、省级、市级课题10余项，获市级课题一、二、三等奖。发表论文10余篇，其中SCI收录1篇。

克拉玛依市中心医院肾病风湿科是本地区唯一的集科研，临床、教学、预防为一体的自治区临床重点专科，床位编制30张，血液透析机30台。全科现有医务人员35名，医生11名，护士24名，其中高级职称5人、中级职称14人，初级职称16人，专业血透护士13人，有硕士研究生5人。自治区重点专科。

呼吸与危重症医学科是自治区重点专科。现有工作人员53人，医师15人(高级职称6人，中级职称3人，初级职称6人)，期中硕士以上学历5人。硕士研究生导师1人，护理人员38人，开设床位57张，其中呼吸重症监护病床10张，普通病床41张，睡眠病床6张。病房区域分一病区、二病区、呼吸重症监护治疗病房、肺功能室、气管镜室、睡眠室、呼吸实验室。在门诊楼设有呼吸科门诊、鼾病门诊。为中日友好医院呼吸专科医联体成员单位，与疆内外多家医院开展远程会诊及合作项目。

消化科拥有消化内镜诊疗中心、消化实验室。仪器设备在国内居于领先水平，配套设施完善备，满足临床及科研需要。是本地区消化疾病诊治的重点科室，承担着消化疾病急危重症救治和常见病的诊治、相关疾病的防治以及教学、科研任务工作。在诊治消化道出血，肝硬化，重症胰腺炎，炎症性肠病、重症肠道感染等消化系统疾病的诊治方面有明显优势。